NVIDIA выпустила BioIR для ускорения предсказания структур белков

NVIDIA анонсировала BioNeMo Inference Runtime (BioIR) — Python-библиотеку для ускорения моделей предсказания структуры белков на GPU. Инструмент уже работает в production: он помог расширить AlphaFold Database, обработав 4,777 протеомов и 31 млн кандидатов на белковые комплексы, из которых 1,81 млн выпущены как высоконадёжные предсказания.

BioIR оптимизирует операции, которые стандартные стеки вывода не полностью ускоряют — Pairformer, Evoformer, треугольные операции и диффузионные трансформеры. Библиотека доступна как open-source репозиторий на GitHub и не требует CUDA toolkit или компиляции.